19世紀(jì)80年代后，隨著西學(xué)的傳播和洋務(wù)運(yùn)動的發(fā)展，科舉制度發(fā)生改變。1888年，清政府準(zhǔn)設(shè)算學(xué)科取士，首次將自然科學(xué)納入考試內(nèi)容。1898年，加設(shè)經(jīng)濟(jì)特科，薦舉經(jīng)時濟(jì)變之才。同時，應(yīng)康有為等建議，廢八股改試策論，以時務(wù)策命題，嚴(yán)禁憑楷法優(yōu)劣定高下。戊戌變法失敗后，慈禧下令所有考試悉照舊制。

1901年9月清廷實(shí)行“新政”后，各地封疆大吏紛紛上奏，重提改革科舉，恢復(fù)經(jīng)濟(jì)特科，1904年，清廷頒布《奏定學(xué)堂章程》，此時，科舉考試已改八股為策論，但尚未廢除。因科舉為利祿所在，人們趨之若鶩，新式學(xué)校難以發(fā)展，因此清廷詔準(zhǔn)袁世凱、張之洞所奏，將育人、取才合于學(xué)校一途。至此，在中國歷史上延續(xù)了1300多年的科舉制度最終被廢除，科舉取士與學(xué)校教育實(shí)現(xiàn)了徹底分離。

1905年9月2日，袁世凱、張之洞奏請立停科舉，以便推廣學(xué)堂，咸趨實(shí)學(xué)。清廷詔準(zhǔn)自1906年開始，所有鄉(xiāng)會試一律停止，各省歲科考試亦即停止，并令學(xué)務(wù)大臣迅速頒發(fā)各種教科書，責(zé)成各督撫實(shí)力通籌，嚴(yán)飭府廳州縣趕緊于鄉(xiāng)城各處遍設(shè)蒙小學(xué)堂。

科舉制度在1905年被廢除的根本原因是科舉制不能滿足國家選拔人才的需要。

科舉制廢除還有以下原因：

1、經(jīng)濟(jì)上，隨著社會的進(jìn)步科舉制已經(jīng)不適應(yīng)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展，阻礙了社會生產(chǎn)力的發(fā)展。

2、政治上，清朝末期統(tǒng)治面臨內(nèi)憂外患的局面，科舉制以失去了為封建王朝服務(wù)的性質(zhì)，在一定程度上阻礙了國家得統(tǒng)治。

3、文化上，西方文化的傳入，使得民主思想有了進(jìn)一步的發(fā)展，開始呼喚改革。