獨龍族的宗教信仰尚處于較原始的自然崇拜和萬物有靈階段。萬物有靈的靈魂觀念是獨龍族宗教的核心。獨龍族認為，自然界的一切都有精靈、靈魂，或鬼神，它們主宰著人們的吉兇安危。正是基于這種認識，沒有足夠的力量了解和戰勝自然災害和抵制疾病的獨龍族，為了祈求鬼靈的庇護，消災免禍，而崇拜著自然界的山川、河流、大樹、怪石等等，并有了自己較具體的信仰對象，出現了祭祀人員，形成了一系列宗教活動，從而構成了富有本民族特色的宗教文化。

(一)生靈“卜拉”和亡魂“阿細”

在獨龍族宗教意識里，人和動物都有兩個靈魂，即生靈“卜拉”和亡魂“阿細”。無論是人還是動物，其肌體賴以存活的生靈“卜拉”，只有在肌體活著的時候才存在。

“卜拉”消失后，人的另一個靈魂，即亡魂“阿細”接踵而至。除巫師外，一般人看不見“阿細”。“阿細”不同于鬼、精靈，它只是住在另一個世界的人。在“阿細”生活的世界里，有山、有水、有村寨，還有眾“阿細”生前曾養過的豬、雞、牛、羊。

(二)地上的鬼“布蘭”和天界的鬼“南木”

獨龍族沒有神的概念，他們只是籠統地把鬼、精靈、神祇等稱為鬼，并把鬼分為住在地上的鬼和天界的鬼，認為地上的鬼是兇惡的、可怕的，對人畜危害極大，而天上的鬼卻是主宰人間生死，庇佑人類的。實際上，天鬼已是獨龍族的人神。

居住在地上的鬼，獨龍語稱“布蘭”。“布蘭”的種類很多。在獨龍族的意識里，大自然中的鬼都是作崇于人，危害于人的都是惡鬼、壞鬼、貪婪鬼。且不同的鬼，對人有不同的危害。

天界上的鬼，獨龍語稱“南木”。

(三)信仰對象——“格蒙”、“布蘭”、“南木”

獨龍族信仰的對象便是格蒙、南木、布蘭。格蒙是獨龍族信奉的最高鬼靈，又譯“木別”、“姆朋”。獨龍族認為，格蒙居住在九層天的第二層，其職責是掌管人間的男女匹配及人的生死，能庇佑、賜福于人類，因此，人們必須祭祀它，以求人畜平安。

南木是天界鬼靈，居住在九層天第二層以下的各層。南木有多種，都是受格蒙派遣到人間司不同職責的，既可以解除人的痛苦或災難，也可害于人，南木又能通過巫師中介與人相通，它較布蘭已具有某種神圣性及權威性。

布蘭居于地上，則是被視作對人畜危害極大，而又無時不在、無所不在的地界鬼精靈。人們或請巫師祭祀它，或請巫師驅逐或砍殺它。在獨龍族神話中，就有不少表現人類與布蘭作斗爭的內容。

(四)巫師

獨龍族巫師分“南木薩”、“龍薩”兩種。南木薩社會地位較高，有的即是頭人。無論是南木薩還是龍薩，都不是專門的職業宗教者，其宗教活動的收入也甚微，平時須參加一定的勞動。巫師傳承也未形成相應的制度和習慣，并且南木薩和龍薩在傳承上也有所不同。龍薩多由父傳其子，個別還有傳給女兒的。也有在日常宗教活動中逐漸觀摩、模仿而成的。充當龍薩者都須是已婚的成年人。而南木薩并非父子要相，也不能傳給外氏族的人，它是氏族保衛神的象征，系自然形成。

南木薩和龍薩職責不同。南木薩主持祭祀、打卦兼治病，不搞殺生驅鬼活動，治病的方式也很獨特，不用中草藥，而是采取一種類似魔術的醫療方法。龍薩則專門替病人殺生驅鬼。

(五)占卜

獨龍族預測吉兇的巫術活動很多。占卜除巫師外，也可由當事人自己進行。占卜的的種類和方式很多，有水卜、酒卜、刀卜、蛋卜、雞卜、谷卜、竹卜、葉卜等，其中以葉卜最為復雜。

(六)基督教

1935年，美籍傳教士莫爾斯進入怒江地區，在茨開、丹當等地設立基督教教堂，并多次派人進入獨龍江地區傳教布道，自此，基督教傳入獨龍族地區。基督教在獨龍族中培養了不少教徒，并對獨龍文化產生了一定的影響。