關于珍妃，很多人都說她干預朝政，賣官鬻爵。根據清宮檔案記載，光緒二十年的十月二十八日，珍妃受到了褫衣廷杖的處分。有傳聞說，光緒皇帝給慈禧請安的時候，太后鐵青著臉，根本不理睬皇帝。光緒就在這種尷尬的沉默中跪了兩個多小時，動也不敢動。最后慈禧惡狠狠摔下一句話，說：“瑾妃、珍妃的事，你不管，我來管。不能讓她們破壞家法，干預朝政，下去吧！”

翁同龢也曾在時候在慈禧面前為珍妃和瑾妃求情，希望慈禧太后能夠緩一緩，但被慈禧果斷拒絕，連翁師傅的面子也不給，可見這件事情的嚴重性。那么，珍妃究竟有沒有干預朝政呢？

珍妃和瑾妃的親屬在回憶文章中披露，甲午戰爭中，珍妃和老師文廷式以及堂兄志銳屬于主戰派，和主和派之間矛盾沖突十分激烈，文廷式和志銳把戰爭失敗的責任全部算在李鴻章身上，狠狠參奏過李鴻章一本，李鴻章大怒，唆使親家楊崇伊彈劾珍妃干預朝政，與文廷式和志銳一干人等策劃反對慈禧，支持光緒皇帝自主朝綱。此奏一上，戳中了慈禧太后最擔心的痛點，于是，文廷式被革職驅逐，志銳被發往烏里雅蘇臺，出任參贊大臣。

還有人說，珍妃交通外官，把上海的蘇松泰道員買了不少錢。事情被慈禧知道了，十分震怒，把珍妃叫來大罵一頓，說：“連祖宗家法都不遵守，眼里還有我嗎？”不由分說，吩咐左右痛加責打。根據檔案留下來的脈案，就在事發時間左右，太醫給珍妃開具的病癥中顯示：“抽搐氣閉，牙關緊急，周身筋脈顫動刻間。”突然出現這樣的情況，估計是被打之后的情況無疑。就在珍妃被打得不省人事之際，慈禧頒下懿旨，將瑾、珍二妃降為貴人，說是“以示薄懲，而肅內政。”

為了配合懲罰，加強教育，慈禧專門制作了兩塊禁牌，如今仍然保存在故宮博物院。第一塊禁牌上寫著：光緒二十年十一月初一日奉皇太后懿旨，皇后有統轄六宮之責，俟后，妃嬪等如有不尊家法，在皇帝前干預國政、顛倒是非，著皇后嚴加訪查，據實陳奏，從重懲辦，決不寬貸，欽此！這明顯是在替自己的侄女隆裕皇后撐腰。但也透露出珍妃被貶的原因：“干預國政，顛倒是非”

第二塊禁牌寫著：光緒二十年十一月初一日奉皇太后懿旨瑾貴人、珍貴人著加恩準其上殿當差隨侍，謹言慎行，改過自新，平素妝飾衣服，俱按宮內規矩穿戴，并一切使用物件不準為例。皇帝前遇年節照例準其呈進食物，其余新巧稀奇物件及穿戴等項不準私自呈進，如有不遵者重責不貸，特諭。

這里面說的，就是鮮活的珍妃形象了：在皇帝面前很活潑，敢講話，不拘小節，經常會搞出些稀奇古怪的玩意兒逗皇上開心，她穿著不循規矩，卻總能給光緒皇帝新鮮的感覺，也難怪光緒如此寵愛她了。

至于干預國政，到底是所為何事，并沒有留下確鑿的證據，總之，慈禧在光緒二十年嚴厲處分珍妃，一定和甲午中日戰爭的大背景脫不開干系。慈禧從一開始看不慣珍妃到這個時候下決心狠狠懲治，想必也和帝后之間的權力爭斗有著千絲萬縷的聯系。慈禧對珍妃開始懷有敵意，一方面是不希望她壓著自己的侄女隆裕皇后，另一方面，如此聰明大膽的女子在光緒身邊，總是令她十分不安的，這兩塊牌子就是明證。