朱熹大肆鼓吹“革盡人欲，復盡天理”，但在宋慶元二年(1196年)，監察御史沈繼祖卻列舉了大量事實，揭露他言行不一：他曾引誘兩個尼姑做妾，出去做官時都帶著她們;他的大兒媳在丈夫死后卻懷了孕，等等。(《四朝聞見錄》丁集。)這真是特大丑聞，程、朱理學一時名聲很壞。

宋寧宗降旨要貶朱熹的官，朱熹嚇得趕緊上表認罪，不僅承認了納尼做妾等事，連幾十年“正心誠意”的大學問也不講了，說自己是“草茅賤士，章句腐儒，唯知偽學之傳，豈適明時之用”，表示要“深省昨非，細尋今是”。(《朱文公文集》卷八十五。)這些事都表現出朱熹等人的丑惡與虛偽。陳亮等人和他反復辯論多年，他始終堅持自己的觀點，現在一看政治風向不對，馬上承認自己大力提倡的那一套是“偽學”，要“深省昨非”了，這是非常沒有原則與節操的態度。

朱熹還有一件被人議論紛紛的事情。當時的天臺有一個叫嚴蕊的營妓，文才、音樂、歌舞都好，色藝冠一時。有一個叫唐與正的人做臺州知州時宴客，曾叫嚴蕊陪過酒，嚴蕊即席賦詞，唐與正很欣賞她的文才，賞賜她兩疋縑帛。以后，朱熹來了，任提舉浙東常平茶鹽公事，在浙東路巡視部屬。他想把唐與正扳下來，要找他的“罪狀”，就想在嚴蕊這邊打開缺口，因為知州作為一州的行政長官，必須是民望所歸，如果和營妓有奸情，必然有傷風化。可是，找嚴蕊來問，嚴蕊堅不承認和唐與正有什么茍且的事，無論怎么誘供、拷打，都不承認，于是把她關在獄中幾個月，一再受刑，被打得死去活來，仍咬牙不承認。

有的獄官可憐她，勸她說，你是個妓女，這種事也不是什么大罪，你就承認了吧，何必這么挺著受罪呢？嚴蕊說，我是個賤妓，即使和太守有什么性關系，也不是什么大罪，對此我是明白的，但是事實是怎么樣就是怎么樣，怎么可以亂說呢，我雖死也不能誣陷別人啊！于是朱熹把她再關再打，仍無結果。這件事傳出去以后，許多人都敬佩嚴蕊，甚至孝宗皇帝都知道了這件事。

不久，朱熹被調走了，岳霖(岳飛的第三子)為御史，過問了這件事。在提訊嚴蕊時，叫她作一首詞以表白自己，嚴蕊不假思索地口賦《卜算子》一首：“不是愛風塵，似被前緣誤。花落自有花開時，總賴東君主。去也終須去，住也如何住，若得山花插滿頭，莫問奴歸處。”(周密：《齊東野語》。)這首詞很有名，流傳至今。岳霖很同情她，當天就判決她從良，她后來被一個宗室納為妾，得以善終。

從這件事可以看出朱熹的丑惡人品，且不論他羅織罪名陷害官員是十分卑劣的，而為什么要這么拷打一個無辜的妓女且要致以死地呢？身為營妓，任人攀折，特別是官員要她怎么樣，她能不聽命嗎？何況還沒有這回事！而且，朱熹“納尼做妾”，又有什么資格道貌岸然地在公堂上查別人“嫖妓”的事呢？皇帝要查他的事了，他就嚇得屁滾尿流，承認自己是“腐儒”、“偽學”，要“深省昨非，細尋今是”，把自己徹底否定，把自己畢生鼓吹的“正心誠意”那一套“大學問”徹底否定了，他還真不如那個堅持真理、寧死不屈的妓女來得有骨氣呢！