南昌會戰(zhàn)，中國軍隊既未能在防御中守住南昌，也未能在反攻中奪回南昌。但它在軍事、政治上的影響，卻有積極的一面。南昌會戰(zhàn)表明日軍雖然占領了武漢三鎮(zhèn)，但既未能迫使國民政府屈服，也未能擊殲中國軍隊的主力，更沒有摧毀中國廣大軍民的抗戰(zhàn)意志。中國軍隊不僅繼續(xù)進行抗戰(zhàn)，而且還開始實施戰(zhàn)役范圍的反攻，這是“七七”事變以來的新發(fā)展，同時也證 明國民政府軍事委員會在戰(zhàn)略指導上確有改單純防御為攻勢防御的意圖。可惜的是，由于最高決定者和某些高級將領，或是理論與實踐脫節(jié)，或是缺乏優(yōu)良的戰(zhàn)略戰(zhàn)術素養(yǎng)，以致在作戰(zhàn)指導和作戰(zhàn)指揮上產生不少失誤，在造成消耗敵人的同時，過多地消耗了自己，卻未能實現(xiàn)自己的戰(zhàn)役企圖。

方針相抵

蔣介石在口頭上一再聲稱“不復與敵人作一點一線之爭奪”，“我軍作戰(zhàn)之方略在消耗敵人而不被敵人消耗，避實擊虛，造成持久抗戰(zhàn)之目的”等等，但是在反攻南昌的作戰(zhàn)中，當奇襲未能成功、已形成以弱我向強敵進行陣地攻堅戰(zhàn)時，不顧戰(zhàn)場的實際情況，仍限令于5月 5日前攻下南昌，以致不僅南昌未能按其主觀愿望攻克，而且部隊遭到大量不必要的傷亡。

判斷錯誤

第九戰(zhàn)區(qū)保衛(wèi)南昌選定的主要防御方向為南潯鐵路方面，而日軍的主突方向則在修水以西，相差甚遠。有些擔任防御的軍隊(第79、第49軍等)僅部署1個師在第一線，正面長達15公里，而軍的主力卻部署在第一線后方1日行程之處，這在當時的機動條件下不僅策應困難，而且也違反了以軍為基本戰(zhàn)略單位、軍長應直接指揮戰(zhàn)斗的原則，致一點被突破，即全線陷于被動，不能有效地遏止、遲滯敵人。

執(zhí)行不力

反攻南昌作戰(zhàn)計劃的主要內容是以主力進攻南潯路沿線之敵，徹底破壞交通，切斷日軍的增援及聯(lián)絡，以一部攻南昌。而擔任這一主要任務的第1集團軍和第74軍為相隔甚遠的幾個日軍獨立據點所阻，無一點兵力進至南潯路上，對戰(zhàn)役產生極不利的影響。

遭受毒氣

這也是修水防線被迅速突破和中國軍隊在戰(zhàn)斗中傷亡慘重的重要原因之一。日軍在強渡修水前進行炮火準備時，使用了全部能夠發(fā)射毒氣彈的火炮進行急襲，僅19時20分至30分的最后10分鐘中，即發(fā)射毒氣彈3000余發(fā)。緊接著，日軍野戰(zhàn)毒氣隊又在12公里進攻正面上施放了中型毒氣筒15000個(其中第101師團正面施放了5000個，106師團正面施放了10000個)，修水河中國守軍陣地的2公里縱深內完全為毒氣所籠罩。守軍傷亡極重，當時中毒的團以上軍官即有第26師師長王凌云、旅長龔傳文、團長唐際遇和第105師的團長于禬源等。部隊缺乏防毒手段及措施，處于驚慌之中，指揮失靈，致戰(zhàn)斗力接近喪失，日軍得以順利渡過修水河。參加南昌會戰(zhàn)的日軍野戰(zhàn)重炮兵第15聯(lián)隊聯(lián)隊長佐佐木孟久大佐，在其所著《十加部隊的變遷》中說：“3月21日拂曉是陰天，有約3米/秒的風吹向敵方，這是使用特種彈的絕好天氣。按照預定計劃，從拂曉開始，進行試射、校正射效，以后轉入炮火準備后，140門大炮的炮聲蓋住了修水河畔，實為壯烈。最后發(fā)射特種彈，親眼目睹了濃濃的紅云滲透至敵陣的情景。結束炮火準備后，前沿步兵放射特種筒，戰(zhàn)斗進展很順利。當炮兵按計劃延伸射擊后，步兵一齊進攻，突入敵陣……如入無人之境。”與此同時，日軍第6師團第11旅團在進攻武寧中國軍隊陣地時，也使用了大量含有窒息性毒氣的特殊發(fā)煙筒12個，致守軍官兵500人遭烈性毒氣傷害，陣地被攻占。由于日軍規(guī)定“對特種煙實施地區(qū)，務期殲滅華軍，希圖滅口”，所以據被俘的日軍上等兵野上今朝雄筆供，在武寧中毒的中國官兵全部被日軍刺殺。以后在高安附近戰(zhàn)斗及強渡錦江等作戰(zhàn)時，均曾使用了大量的毒氣彈和毒氣筒。